在合肥注册食品加工公司，涉及的许可证和卫生标准是确保企业合法运营和产品质量的关键环节。以下是详细的办理流程和标准要求。

一、所需办理的许可证

1.食品生产许可证：这是食品加工企业必须取得的核心许可证，由合肥市市场监督管理局颁发。申请时需提交企业基本信息、生产工艺流程、质量控制体系等详细资料。

2.卫生许可证：由合肥市卫生健康委员会颁发，主要审核企业的生产环境、卫生设施、员工健康状况等。

3.营业执照：在合肥市市场监督管理局办理，是企业合法经营的基础证件。

4.税务登记证：在合肥市税务局办理，确保企业依法纳税。

二、卫生标准要求

1.生产环境卫生：生产车间必须保持清洁，定期消毒，防止污染源进入。

2.设备卫生：所有生产设备需定期清洗和消毒，确保无残留物。

3.员工卫生：员工需定期体检，工作时穿戴整洁的工作服和防护用品。

4.原料和成品管理：原料需符合国家食品安全标准，成品需经过严格的质量检测。

通过以上详细的许可证办理流程和卫生标准要求，企业可以确保在合肥合法、安全地开展食品加工业务。